Estantes superiores
A galeria ou Ordem superior da BPNMafra possui LXXXII estantes, com I a XVIII prateleiras cada, perfazendo um total de 1140 casas. As seis ordens das LXXXII estantes contam-se de cima para baixo e da esquerda para a direita.
A varanda, situada a 3,30 m do solo, tem parapeito de balaustres, assente em mísulas de talha, avançando sobre o salão cerca de 1,15 m.
As pilastras que dividem as estantes superiores são encimadas por fogaréus, não tendo sido nunca concretizado o projecto dos Cónegos Regrantes de fazer pintar sobre os títulos bibliográficos os bustos dos autores mais ilustres dos ramos do saber representados em cada estante.
1 - Bíblias, Filologia Sagrada e História da Vida de Jesus Cristo
2 - Expositores do Antigo e Novo Testamento
3 - Expositores do Antigo e Novo Testamento. Instruções sobre as Epístolas e Evangelhos do Ano
4 - Expositores do Novo Testamento, Homílias e Meditações sobre as Epístolas e Evangelhos de todo o Ano
5 - Homílias sobre os Evangelhos das Domínicas e Festas do Ano
6 - Teologia Parenética. Homílias e Sermões Latinos e Italianos
7 - Homílias e Sermões Franceses
8 - Sermões Espanhóis
9 - Idem
10 - Sermões Portugueses
11 - Idem
12 - Teologia Catequética
13 - Teologia Mística em geral
14 - Meditações Místicas e Tratados diversos
15 - Vária Miscelânea Mística, Novenários, etc.
16 - Direito Canónico em geral e particular
17 - Direito Canónico Regular e Estatutos das Ordens Religiosas
18 - Gramática Hebraica, Grega e Latina
19 - Gramáticas e Dicionários das Línguas da Europa
20 - Retórica e Eloquência
21 - Eloquência Oratória e Poética
22 - Poetas Gregos e Latinos
23 - Poetas Italianos, Franceses, Ingleses e Alemães
24 - Poetas Espanhóis e Portugueses
25 - Poesia
26 - História Bibliográfica
27 - História Literária em geral e particular
28 - História, Actas e Memórias Académicas
29 - Poligrafia, Cartas e Miscelânea Erudita
30 - Medicina em geral e particular
31 - Idem
32 - Cirurgia, Anatomia, Química, Farmácia e Botânica
33 - História Filosófica e Filosofia Antiga e Moderna
34 - Filosofia Moderna em geral
35 - Lógica, Metafísica e Ética
36 - Economia Política e Diplomática
37 - Física e História Natural em geral
38 - História Natural em particular, Agricultura, Botânica
39 - Matemática em geral e particular
40 - Astronomia e outros Tratados de Matemática
41 - Artes Liberais e Mecânicas
42 - Jurisprudência Civil em geral
43 - Diversos Tratados de Direito Civil
44 - Miscelânea
45 - Direito Civil Germânico, Francês e Espanhol
46 - Vários Tratados de Direito Civil
47 - Legislação Portuguesa
48 - Direito Civil Lusitano
49 - Vária Miscelânea Proibida
50 - Idem
51 - Idem
52 - Geografia e Viagens
53 - Idem
54 - História e Literatura Portuguesa
55 - História Portuguesa em geral e particular
56 - História da Espanha em geral e particular
57 - História da Inglaterra, Rússia e outros Reinos do Norte
58 - História da França em geral e particular
59 - História Germânica, Romana e dos Ducados de Itália
60 - Antiguidades Romanas. História Grega e Peregrina
61 - História Universal e Jornais, Gazetas e Mercúrios
62 - História do Mundo e de todos os Tempos
63 - História Universal e Princípios Cronológicos para o seu estudo
64 - História das Pessoas Ilustres e das religiões militares
65 - História das Religiões Monacais e Mendicantes
66 - História Santa ou Vidas de Santos
67 - História Eclesiástica Francesa, Espanhola e Portuguesa
68 - História dos Hereges, Concílios e Disciplina da Igreja
69 - História Eclesiástica em geral e particular dos Pontífices,
Cardeais, Arcebispos e Bispos
70 - História Eclesiástica em geral e do Povo de Deus em particular
71 - Liturgia em geral e particular
72 - Vários Tratados dos Sacramentos. Exame de Bispos
73 - Teologia Moral em geral e particular
74 - Sumas, Compêndios e Resoluções de Moral
75 - Teologia Moral
76 - Teologia Polémica
77 - Teologia
78 - Teologia Dogmática em geral. Tratados de Deus Uno, Trino,
da Encarnação e da Graça
79 - Teologia Dogmática em geral
80 - Idem
81 - Teologia Dogmática em geral e particular
82 - Santos Padres e Escritores Eclesiásticos e Intérpretes da Sagrada Escritura